Aastatel 1991–1999 töötas ta Eesti Televisioonis filmisaadete toimetajana ("Ffriik!". "Ffriigi teataja", "Griša", "Antoša", "Kaadris"). Aastatel 1995–1998 oli ta Kultuurilehe ja Eesti Ekspressi TV-Nädala filmi- ja teletoimetaja, 1998–2000 Postimehe kultuuritoimetuse filmitoimetaja. Lõhmus on avaldanud Eesti ajakirjanduses rohkem kui 400 filmikirjutist.

1996. aastal valiti Lõhmus aasta filmiajakirjanikuks. Samal aastal pälvis ta Eesti Kultuurkapitali audiovisuaalse kunsti sihtkapitali aastapreemia filmikriitika eest. 2012. premeeriti teda samuti kultuurkapitali aastapreemiaga panuse eest projekti Eesti Film 100, mille raames sai Lõhmuse eestvõttel teoks Eesti filmiklassika DVD-sari.

Lõhmus andis loenguid Eesti, Euroopa ja maailma filmiajaloost Tallinna Pedagoogikaülikooli, Balti Filmi- ja Meediakooli ja Eesti Kunstiakadeemia üliõpilastele ja magistrantidele. Ta oli Eesti Filmiajakirjanike Ühingu liige.

Aastatel 2000–2006 oli Jaak Lõhmus Eesti Filmi Sihtasutuse peaekspert. 2023. aastal pälvis Lõhmus ka Valgetähe V klassi teenetemärgi.