Igal aastal on Niguliste muuseumi jõulukuusel olnud ka kindel teema. Esimesel korral, 2016. aasta jõuludeks üles seatud kuuse ehtimisel ammutati inspiratsiooni Niguliste kuulsaimast teosest, Bernt Notke maalist "Surmatants". 2017. aastal lähtus jõulukuusk hoopis viktoriaanlikest jõulutraditsioonidest. 2018. aastal tähistati Eesti Vabariigi 100. sünnipäeva ning jõulukuusk oli senisest pidulikum ja pühendatud kodumaa juubelile. 2019. aastal oli jõulupuu paradiisiteemaline ja värvikirevate papagoidega, 2020. aastal oli teemaks looduslähedus ja keskkonnasäästlikkus ning 2021. aastal värviküllus. Eelmisel, 2022. aastal oli Niguliste muuseum rekonstrueerimistööde tõttu suletud.

Dekoratsioonifirma Shishi ehitud jõulupuu on Nigulistes juba seitsmendat aastat. Lisaks ehitud jõulukuusele toimub Niguliste muuseumis ka spetsiaalne pühadeprogramm orelikontsertide ning jõuluekskursiooonidega.